Lễ bôc thăm vòng chung kết diễn ra vào ngày 18 tháng 6 năm 2020, 16:30 MYT (UTC+8), tại Trụ sở AFC tại Kuala Lumpur.[12][13]. 16 đội tuyển được rút thăm chia thành bốn bảng bốn đội, với các đội tuyển được hạt giống theo thành tích của họ trong vòng loại và vòng chung kết Giải vô địch bóng đá U-19 châu Á 2018, với đội chủ nhà Uzbekistan tự động được hạt giống và được gán cho Vị trí A1 trong bốc thăm.